Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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SIX1Q15475 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SIX1Q15475 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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