Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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