Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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