Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms