Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms