Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CSNK2A1P68400 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms