Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms