Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms