Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms