Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THOP1P52888 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THOP1P52888 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THOP1P52888 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THOP1P52888 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms