Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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