Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms