Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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