Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBP2P32456 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBP2P32456 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBP2P32456 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms