Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms