Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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