Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODC1P11926 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms