Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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