Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRD1A4D1F6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRD1A4D1F6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRD1A4D1F6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRD1A4D1F6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRD1A4D1F6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms