Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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