Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms