Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms