Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms