Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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