Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms