Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLASP1Q7Z460 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms