Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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USP34Q70CQ2 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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