Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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