Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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