Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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GBX1Q14549 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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