Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms