Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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