Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PKP1Q13835 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms