Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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