Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NAE1Q13564 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms