Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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