Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms