Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms