Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms