Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CYB5B-204ENST00000515314 1658 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CLEC12B-201ENST00000338896 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC093732.1-201ENST00000422201 504 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RRM1-AS1-201ENST00000529323 346 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BEAN1-AS1-203ENST00000569125 530 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 U62317.5-201ENST00000609268 362 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 IL15-203ENST00000394159 1545 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms