Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC016956.1-201ENST00000393026 1108 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC138356.3-201ENST00000523507 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MIR100HG-211ENST00000531071 970 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC009088.1-201ENST00000565152 833 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PSMC1P10-201ENST00000434820 1327 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RAD51B-201ENST00000390683 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NIFKP1-201ENST00000398317 889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MRPS31P5-202ENST00000423686 920 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC093714.1-201ENST00000470532 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC093857.1-201ENST00000511603 760 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ENOPH1-204ENST00000610545 1542 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms