Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms