Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms