Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRE11P49959 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRE11P49959 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRE11P49959 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRE11P49959 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms