Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms