Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.9 ms