Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSR1P43307 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSR1P43307 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSR1P43307 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSR1P43307 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSR1P43307 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms