Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms