Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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