Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTSS1O43312 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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